El laboratorio de aguas fue creado en el 2007 con la finalidad de servir como un centro de análisis de la calidad del agua. Este centro de análisis tiene finalidades académicas y de investigación. En el se dan prácticas para los estudiantes de la carrera de IAD así como para los estudiantes de los módulos de Aprender Haciendo en dicha temática. Desde su creación se han llevado a cabo múltiples proyectos de investigación, principalmente por medio de estudiantes que han realizado y realizan sus proyectos especiales de graduación. De igual manera el laboratorio ha servido como base para conducir otros proyectos y para el entrenamiento de participantes en diplomados sobre la calidad del agua.
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