La Junta de Fiduciarios es la máxima autoridad de Zamorano. Sus objetivos primordiales son velar por la misión, dirección y salud general de la institución. Entre sus funciones también está nombrar el rector y refrendar el nombramiento de las posiciones superiores de la universidad, aprobar los planes estratégicos y anuales, así como la obtención de financiamiento y otros apoyos para el cumplimiento de los objetivos institucionales.

La Junta de Fiduciarios de Zamorano está compuesta por personas de diversas nacionalidades y profesiones, todos de reconocida trayectoria que comparten ideas, compromisos y propósitos altruistas comunes en beneficio de Latinoamérica, su juventud, y el desarrollo de sus países. Los fiduciarios de Zamorano se caracterizan por poseer un alto sentido de la filantropía, todos son voluntarios que donan tiempo, conocimientos, experiencia, imagen e incluso sus propios recursos financieros. Algunos de ellos han llegado a impulsar y acompañar el progreso constante de la institución por mucho tiempo, siendo responsables de la gran evolución Zamorana de los últimos años.